Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS0

Ecrg4, Augurin, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecrg4Q99LS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ecrg4Q99LS0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ecrg4Q99LS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ecrg4Q99LS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ecrg4Q99LS0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecrg4Q99LS0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ecrg4Q99LS0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecrg4Q99LS0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecrg4Q99LS0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ecrg4Q99LS0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms