Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pls3Q99K51 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pls3Q99K51 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls3Q99K51 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls3Q99K51 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls3Q99K51 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms