Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1dQ99246 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1dQ99246 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1dQ99246 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1dQ99246 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1dQ99246 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms