Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn4Q925N1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn4Q925N1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfxn4Q925N1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfxn4Q925N1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms