Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc49Q91YK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc49Q91YK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc49Q91YK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms