Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam3cQ91VU0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam3cQ91VU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam3cQ91VU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam3cQ91VU0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fam3cQ91VU0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam3cQ91VU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms