Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SfpqQ8VIJ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SfpqQ8VIJ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SfpqQ8VIJ6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SfpqQ8VIJ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SfpqQ8VIJ6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms