Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHP9

Asb17, Ankyrin repeat and SOCS box protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asb17Q8VHP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Asb17Q8VHP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Asb17Q8VHP9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Asb17Q8VHP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Asb17Q8VHP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms