Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r200Q8R281 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r200Q8R281 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vmn1r200Q8R281 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vmn1r200Q8R281 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r200Q8R281 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Vmn1r200Q8R281 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms