Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkd3Q8K1Y2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prkd3Q8K1Y2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prkd3Q8K1Y2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prkd3Q8K1Y2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms