Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx5Q8K1E0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Stx5Q8K1E0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Stx5Q8K1E0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx5Q8K1E0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx5Q8K1E0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms