Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn3Q8K045 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn3Q8K045 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkn3Q8K045 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkn3Q8K045 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms