Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lrrc45Q8CIM1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lrrc45Q8CIM1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lrrc45Q8CIM1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc45Q8CIM1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc45Q8CIM1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms