Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rp1l1Q8CGM2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rp1l1Q8CGM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rp1l1Q8CGM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rp1l1Q8CGM2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rp1l1Q8CGM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms