Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc178Q8CDV0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc178Q8CDV0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc178Q8CDV0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms