Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hdac7Q8C2B3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hdac7Q8C2B3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hdac7Q8C2B3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hdac7Q8C2B3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms