Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg16l1Q8C0J2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg16l1Q8C0J2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg16l1Q8C0J2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg16l1Q8C0J2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg16l1Q8C0J2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms