Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87aQ8BXN9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem87aQ8BXN9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem87aQ8BXN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem87aQ8BXN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem87aQ8BXN9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms