Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRK8

Prkaa2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa2Q8BRK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkaa2Q8BRK8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkaa2Q8BRK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkaa2Q8BRK8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prkaa2Q8BRK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms