Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabra5Q8BHJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabra5Q8BHJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra5Q8BHJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gabra5Q8BHJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra5Q8BHJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms