Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim6Q8BGE7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim6Q8BGE7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim6Q8BGE7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim6Q8BGE7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim6Q8BGE7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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