Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Npas4Q8BGD7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24,72■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
Npas4Q8BGD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,67■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Npas4Q8BGD7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Npas4Q8BGD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Npas4Q8BGD7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Npas4Q8BGD7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,8 ms