Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-M10.6Q85ZW5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.6Q85ZW5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms