Protein–RNA interactions for Protein: Q812A5

Prr5, Proline-rich protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr5Q812A5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr5Q812A5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr5Q812A5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prr5Q812A5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr5Q812A5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr5Q812A5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms