Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc1Q80VQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc1Q80VQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc1Q80VQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc1Q80VQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc1Q80VQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc1Q80VQ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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