Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SpopQ6ZWS8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SpopQ6ZWS8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpopQ6ZWS8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpopQ6ZWS8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpopQ6ZWS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110 ms