Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp8b3Q6UQ17 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp8b3Q6UQ17 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp8b3Q6UQ17 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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