Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
GmipQ6PGG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,08■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
GmipQ6PGG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,06■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
GmipQ6PGG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24,97■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
GmipQ6PGG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24,93■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,9■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
GmipQ6PGG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24,83■■□□□ 1,57
GmipQ6PGG2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,3 ms