Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pik3c3Q6PF93 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pik3c3Q6PF93 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pik3c3Q6PF93 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pik3c3Q6PF93 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pik3c3Q6PF93 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms