Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dhx40Q6PE54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dhx40Q6PE54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dhx40Q6PE54 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Dhx40Q6PE54 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms