Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa4Q6P8K8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa4Q6P8K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpa4Q6P8K8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpa4Q6P8K8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa4Q6P8K8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms