Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gga2Q6P5E6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gga2Q6P5E6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gga2Q6P5E6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gga2Q6P5E6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gga2Q6P5E6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms