Protein–RNA interactions for Protein: Q6A026

Pds5a, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5aQ6A026 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pds5aQ6A026 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pds5aQ6A026 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pds5aQ6A026 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pds5aQ6A026 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pds5aQ6A026 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms