Protein–RNA interactions for Protein: Q67BJ4

A4galt, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4galtQ67BJ4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4galtQ67BJ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4galtQ67BJ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A4galtQ67BJ4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
A4galtQ67BJ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
A4galtQ67BJ4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
A4galtQ67BJ4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A4galtQ67BJ4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms