Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp9cQ66X01 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp9cQ66X01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp9cQ66X01 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp9cQ66X01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp9cQ66X01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms