Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms