Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ccdc18Q640L5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ccdc18Q640L5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ccdc18Q640L5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ccdc18Q640L5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ccdc18Q640L5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc18Q640L5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
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