Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lcn4Q62472 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lcn4Q62472 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lcn4Q62472 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn4Q62472 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn4Q62472 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms