Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Six1Q62231 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Six1Q62231 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Six1Q62231 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Six1Q62231 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six1Q62231 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Six1Q62231 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six1Q62231 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Six1Q62231 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms