Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sema3cQ62181 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sema3cQ62181 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema3cQ62181 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3cQ62181 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3cQ62181 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms