Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema4bQ62179 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema4bQ62179 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema4bQ62179 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema4bQ62179 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema4bQ62179 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms