Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Foxd1Q61345 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Foxd1Q61345 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Foxd1Q61345 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Foxd1Q61345 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Foxd1Q61345 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Foxd1Q61345 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms