Protein–RNA interactions for Protein: Q61316

Hspa4, Heat shock 70 kDa protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4Q61316 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4Q61316 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4Q61316 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hspa4Q61316 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4Q61316 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hspa4Q61316 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hspa4Q61316 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hspa4Q61316 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4Q61316 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4Q61316 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms