Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacna1eQ61290 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacna1eQ61290 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacna1eQ61290 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacna1eQ61290 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms