Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tsg101Q61187 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsg101Q61187 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsg101Q61187 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsg101Q61187 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsg101Q61187 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms