Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PapolaQ61183 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PapolaQ61183 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolaQ61183 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PapolaQ61183 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms