Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sim1Q61045 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sim1Q61045 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sim1Q61045 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sim1Q61045 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sim1Q61045 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sim1Q61045 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms