Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DbpQ60925 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
DbpQ60925 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
DbpQ60925 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
DbpQ60925 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DbpQ60925 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DbpQ60925 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DbpQ60925 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DbpQ60925 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DbpQ60925 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DbpQ60925 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DbpQ60925 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DbpQ60925 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms