Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2f1Q60632 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nr2f1Q60632 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nr2f1Q60632 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nr2f1Q60632 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr2f1Q60632 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms