Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms