Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zmat1Q3V0C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zmat1Q3V0C1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zmat1Q3V0C1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zmat1Q3V0C1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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